真道幸路朗，就职于外务省，是一位拥有出色能力的交涉官。一日，在羽田机场，当真道所乘坐的客机准备起飞时，突然上空出现了谜之巨大立方体。“那个”急速地巨大化，并且吞噬了这架载有252人的客机。 巨大立方体名为「KADO(门)」。从KADO中现身的谜之存在——雅哈奎扎修尼那尝试着与人类的接触。而被困在KADO之中的真道，成为了雅哈奎扎修尼那与人类之间负责穿针引线的调停人。 另一方，日本政府派来国际交涉官·徭沙罗花作为代表送到了事件现场。 雅哈奎扎修尼那到底是何方人物？他的目的又是什么？